زئوتکنیک Zootechnie

برای علاقمندان پرورش و اصلاح نژاد دام

Calcul de la puissance d’un protocole

l faut décompresser l’archive .zip et installer les 3 logiciels en exécutant les setup.exe présents dans les 3 répertoires.

************ Powdaug.exe : ************

CE programme permet de calculer la puissance de détection d’un QTL dans un protocole de type pere en fonction :

-  du nombre de pere, fille/pere
-  de h²
-  de la probabilité d’un pere d’être héterozybote au QTL (generalement on utilise 0.5)
-  de l’erreur de 1° espèce
-  de la taille de l’effet du QTL (en ecart type phenotypique)
-  du taux de recombinaison entre le marqueur et le QTL (=0.5*(1-exp(-2d) ou d=distance maximale entre le marqueur et le QTL en morgan)

ex du calcule du taux de rec : 2 marqueurs/ chr --> d=0.25 --> taux de rec=0.20

********** powF2.exe : **********

CE programme permet de calculer la puissance de détection d’un QTL dans un protocole F2 (croisement entre lignées inbred) en fonction :

-  du nombre de F2
-  de l’erreur de 1° espèce
-  de la taille de l’effet du QTL (en ecart type phenotypique)
-  du taux de recombinaison entre le marqueur et le QTL (=0.5*(1-exp(-2d) avec l’equation de Haldane ou d=distance maximale entre le marqueur et le QTL)

ex du calcule du taux de rec : 2 marqueurs/ chr --> d=0.25 --> taux de rec=0.20

********** Powsel.exe : **********

CE programme permet de calculer la puissance de détection d’un QTL dans un protocole de type pere lorsqu’on pratique du selective genotyping, en fonction :

-  du nombre de pere, fille/pere
-  de h²
-  de la fraction d’animaux typée
-  de la probabilité d’un pere d’être héterozybote au QTL (generalement on utilise 0.5)
-  de l’erreur de 1° espèce
-  de la taille de l’effet du QTL (en ecart type phenotypique)
-  du taux de recombinaison entre le marqueur et le QTL (=0.5*(1-exp(-2d) ou d=distance maximale entre le marqueur et le QTL)

ex du calcule du taux de rec : 2 marqueurs/ chr --> d=0.25 --> taux de rec=0.20


Fichier ZIP a décompresser sur votre ordinateur

  
نویسنده : رأفت ; ساعت ۱٠:٠٥ ‎ب.ظ روز ۱٥ بهمن ۱۳۸٥
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